RNA–Protein interactions for RNA: YER104W

RTT105, Transcript of Protein with a role in regulation of Ty1 transposition, yeastyeast

Gene RTT105, Length 627 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT105YER104W FAP1P53971 965 aa14.18□□□□□ -0.14
RTT105YER104W MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
RTT105YER104W PRY3P47033 881 aa13.37□□□□□ -0.27
RTT105YER104W AAD16Q02895 342 aa12.7□□□□□ -0.38
RTT105YER104W PRI1P10363 409 aa12.6□□□□□ -0.39
RTT105YER104W YCK3P39962 524 aa12.52□□□□□ -0.41
RTT105YER104W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
RTT105YER104W ISW2Q08773 1120 aa11.97□□□□□ -0.49
RTT105YER104W RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
RTT105YER104W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RTT105YER104W DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RTT105YER104W MRPL32P25348 183 aa11.41□□□□□ -0.58
RTT105YER104W YGL015CP33199 130 aa11.32□□□□□ -0.6
RTT105YER104W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RTT105YER104W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
RTT105YER104W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
RTT105YER104W REB1P21538 810 aa10.67□□□□□ -0.7
RTT105YER104W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RTT105YER104W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
RTT105YER104W CDC27P38042 758 aa10.54□□□□□ -0.72
RTT105YER104W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
RTT105YER104W MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RTT105YER104W SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
RTT105YER104W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RTT105YER104W UBP9P39967 754 aa10.17□□□□□ -0.78
RTT105YER104W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
RTT105YER104W TGL3P40308 642 aa10.04□□□□□ -0.8
RTT105YER104W AVT3P36062 692 aa10.02□□□□□ -0.81
RTT105YER104W SPT21P35209 758 aa9.99□□□□□ -0.81
RTT105YER104W TFC8Q12308 588 aa9.99□□□□□ -0.81
RTT105YER104W HOP09932 586 aa9.98□□□□□ -0.81
RTT105YER104W DCD1P06773 312 aa9.96□□□□□ -0.82
RTT105YER104W SCY1P53009 804 aa9.94□□□□□ -0.82
RTT105YER104W SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RTT105YER104W BCH2P36122 765 aa9.61□□□□□ -0.87
RTT105YER104W YBL029C-AQ3E756 94 aa9.49□□□□□ -0.89
RTT105YER104W MST1P07236 462 aa9.44□□□□□ -0.9
RTT105YER104W RIM101P33400 625 aa9.36□□□□□ -0.91
RTT105YER104W YOR238WQ08634 303 aa9.35□□□□□ -0.91
RTT105YER104W VNX1P42839 908 aa9.34□□□□□ -0.91
RTT105YER104W BDF1P35817 686 aa9.28□□□□□ -0.92
RTT105YER104W EPS1P40557 701 aa9.28□□□□□ -0.92
RTT105YER104W SPP1Q03012 353 aa9.26□□□□□ -0.93
RTT105YER104W YJL171CP46992 396 aa9.24□□□□□ -0.93
RTT105YER104W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.2□□□□□ -0.94not detected
RTT105YER104W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RTT105YER104W FKH1P40466 484 aa9.14□□□□□ -0.95
RTT105YER104W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
RTT105YER104W WSC3Q12215 556 aa9.14□□□□□ -0.95
RTT105YER104W YAP5P40574 245 aa9.1□□□□□ -0.95
RTT105YER104W TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
RTT105YER104W OXP1P28273 1286 aa8.98□□□□□ -0.97
RTT105YER104W BMT6Q12291 365 aa8.98□□□□□ -0.97
RTT105YER104W GTT3P39996 337 aa8.96□□□□□ -0.98
RTT105YER104W LDB19Q12502 818 aa8.95□□□□□ -0.98
RTT105YER104W PTP3P40048 928 aa8.94□□□□□ -0.98
RTT105YER104W BBC1P47068 1157 aa8.92□□□□□ -0.98
RTT105YER104W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RTT105YER104W ULI1P43604 169 aa8.88□□□□□ -0.99
RTT105YER104W IOC2Q12072 812 aa8.86□□□□□ -0.99
RTT105YER104W AI2P03876 854 aa8.78□□□□□ -1
RTT105YER104W RSM7P47150 247 aa8.76□□□□□ -1.01
RTT105YER104W EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
RTT105YER104W MSB4Q12317 492 aa8.7□□□□□ -1.02
RTT105YER104W RTG1P32607 177 aa8.66□□□□□ -1.02
RTT105YER104W PIB1Q06651 286 aa8.65□□□□□ -1.02
RTT105YER104W NCR1Q12200 1170 aa8.65□□□□□ -1.02
RTT105YER104W TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
RTT105YER104W SEC61P32915 480 aa8.56□□□□□ -1.04
RTT105YER104W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RTT105YER104W YOL036WQ08206 761 aa8.54□□□□□ -1.04
RTT105YER104W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RTT105YER104W SET4P42948 560 aa8.53□□□□□ -1.04
RTT105YER104W BCK2P33306 851 aa8.52□□□□□ -1.05
RTT105YER104W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RTT105YER104W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RTT105YER104W SAP30P38429 201 aa8.4□□□□□ -1.06
RTT105YER104W MRM1P25270 412 aa8.39□□□□□ -1.07
RTT105YER104W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RTT105YER104W YLR271WQ06152 274 aa8.34□□□□□ -1.07
RTT105YER104W PRE3P38624 215 aa8.32□□□□□ -1.08
RTT105YER104W YDL129WQ07555 291 aa8.32□□□□□ -1.08
RTT105YER104W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.31□□□□□ -1.08not detected
RTT105YER104W DAN4P47179 1161 aa8.31□□□□□ -1.08
RTT105YER104W JIP4Q03361 876 aa8.31□□□□□ -1.08
RTT105YER104W SAM3Q08986 587 aa8.31□□□□□ -1.08
RTT105YER104W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RTT105YER104W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RTT105YER104W RGA2Q06407 1009 aa8.26□□□□□ -1.09
RTT105YER104W XDJ1P39102 459 aa8.25□□□□□ -1.09
RTT105YER104W YFR006WP43590 535 aa8.24□□□□□ -1.09
RTT105YER104W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RTT105YER104W VPS29P38759 282 aa8.22□□□□□ -1.09
RTT105YER104W VRP1P37370 817 aa8.19□□□□□ -1.1
RTT105YER104W STS1P38637 319 aa8.17□□□□□ -1.1
RTT105YER104W RTG3P38165 486 aa8.15□□□□□ -1.1
RTT105YER104W DPS1P04802 557 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RTT105YER104W HTA1P04911 132 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RTT105YER104W HTA2P04912 132 aa8.14□□□□□ -1.11
RTT105YER104W PTC4P38089 393 aa8.14□□□□□ -1.11
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