Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y9

LY96, Lymphocyte antigen 96, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY96Q9Y6Y9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LY96Q9Y6Y9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LY96Q9Y6Y9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LY96Q9Y6Y9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LY96Q9Y6Y9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LY96Q9Y6Y9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LY96Q9Y6Y9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms