Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
GJA3Q9Y6H8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GJA3Q9Y6H8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GJA3Q9Y6H8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GJA3Q9Y6H8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GJA3Q9Y6H8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GJA3Q9Y6H8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GJA3Q9Y6H8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GJA3Q9Y6H8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GJA3Q9Y6H8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms