Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BSNQ9UPA5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BSNQ9UPA5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BSNQ9UPA5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BSNQ9UPA5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BSNQ9UPA5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BSNQ9UPA5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BSNQ9UPA5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms