Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ERG28Q9UKR5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERG28Q9UKR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERG28Q9UKR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ERG28Q9UKR5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERG28Q9UKR5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERG28Q9UKR5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms