Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBD1Q9UJT1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBD1Q9UJT1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBD1Q9UJT1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TUBD1Q9UJT1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TUBD1Q9UJT1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBD1Q9UJT1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms