Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCHIP1Q9P0W5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCHIP1Q9P0W5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCHIP1Q9P0W5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCHIP1Q9P0W5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SCHIP1Q9P0W5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms