Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CWC15Q9P013 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CWC15Q9P013 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CWC15Q9P013 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CWC15Q9P013 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CWC15Q9P013 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CWC15Q9P013 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CWC15Q9P013 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms