Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LRP1BQ9NZR2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRP1BQ9NZR2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRP1BQ9NZR2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LRP1BQ9NZR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LRP1BQ9NZR2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms