Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms