Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RNF19AQ9NV58 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RNF19AQ9NV58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RNF19AQ9NV58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RNF19AQ9NV58 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF19AQ9NV58 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RNF19AQ9NV58 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RNF19AQ9NV58 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF19AQ9NV58 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms