Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC1

JADE2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2Q9NQC1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
JADE2Q9NQC1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
JADE2Q9NQC1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
JADE2Q9NQC1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
JADE2Q9NQC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
JADE2Q9NQC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
JADE2Q9NQC1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
JADE2Q9NQC1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms