Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
VIPAS39Q9H9C1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VIPAS39Q9H9C1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.57■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.54■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VIPAS39Q9H9C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VIPAS39Q9H9C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VIPAS39Q9H9C1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VIPAS39Q9H9C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VIPAS39Q9H9C1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VIPAS39Q9H9C1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms