Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KRTAP9-2Q9BYQ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KRTAP9-2Q9BYQ4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms