Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM246Q9BRR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM246Q9BRR3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM246Q9BRR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM246Q9BRR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM246Q9BRR3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM246Q9BRR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms