Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RNF5Q99942 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF5Q99942 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RNF5Q99942 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RNF5Q99942 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF5Q99942 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RNF5Q99942 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RNF5Q99942 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF5Q99942 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RNF5Q99942 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF5Q99942 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RNF5Q99942 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RNF5Q99942 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RNF5Q99942 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF5Q99942 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RNF5Q99942 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF5Q99942 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RNF5Q99942 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RNF5Q99942 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RNF5Q99942 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RNF5Q99942 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF5Q99942 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RNF5Q99942 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms