Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CNN2Q99439 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNN2Q99439 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNN2Q99439 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNN2Q99439 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNN2Q99439 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNN2Q99439 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms