Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FUBP1Q96AE4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FUBP1Q96AE4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FUBP1Q96AE4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FUBP1Q96AE4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FUBP1Q96AE4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FUBP1Q96AE4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FUBP1Q96AE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms