Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TRIM52Q96A61 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TRIM52Q96A61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.61■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TRIM52Q96A61 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TRIM52Q96A61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TRIM52Q96A61 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
TRIM52Q96A61 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
TRIM52Q96A61 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
TRIM52Q96A61 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.25■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
TRIM52Q96A61 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms