Protein–RNA interactions for Protein: Q92781

RDH5, 11-cis retinol dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH5Q92781 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RDH5Q92781 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RDH5Q92781 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH5Q92781 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RDH5Q92781 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH5Q92781 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH5Q92781 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms