Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LCN9Q8WX39 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LCN9Q8WX39 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LCN9Q8WX39 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCN9Q8WX39 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCN9Q8WX39 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LCN9Q8WX39 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCN9Q8WX39 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms