Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC44A1Q8WWI5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC44A1Q8WWI5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC44A1Q8WWI5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC44A1Q8WWI5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC44A1Q8WWI5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC44A1Q8WWI5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC44A1Q8WWI5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC44A1Q8WWI5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms