Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRK1Q8WUW1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRK1Q8WUW1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BRK1Q8WUW1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BRK1Q8WUW1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms