Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDZD8Q8NEN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDZD8Q8NEN9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDZD8Q8NEN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDZD8Q8NEN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDZD8Q8NEN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZD8Q8NEN9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms