Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DTX3Q8N9I9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DTX3Q8N9I9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DTX3Q8N9I9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DTX3Q8N9I9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DTX3Q8N9I9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DTX3Q8N9I9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms