Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
VWDEQ8N2E2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC39.8■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
VWDEQ8N2E2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.76■■■■□ 3.95
VWDEQ8N2E2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
VWDEQ8N2E2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
VWDEQ8N2E2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
VWDEQ8N2E2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC39.69■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.63■■■■□ 3.94
VWDEQ8N2E2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
VWDEQ8N2E2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.55■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.52■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.52■■■■□ 3.92
VWDEQ8N2E2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC39.5■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
VWDEQ8N2E2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.42■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.39■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
VWDEQ8N2E2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
VWDEQ8N2E2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
VWDEQ8N2E2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms