Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LINC00518Q8N0U6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00518Q8N0U6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
LINC00518Q8N0U6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00518Q8N0U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LINC00518Q8N0U6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LINC00518Q8N0U6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms