Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NME9Q86XW9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NME9Q86XW9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
NME9Q86XW9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NME9Q86XW9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NME9Q86XW9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NME9Q86XW9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NME9Q86XW9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NME9Q86XW9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NME9Q86XW9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NME9Q86XW9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
NME9Q86XW9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms