Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP34Q70CQ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USP34Q70CQ2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP34Q70CQ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP34Q70CQ2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP34Q70CQ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP34Q70CQ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP34Q70CQ2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP34Q70CQ2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
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