Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00336Q6ZUF6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00336Q6ZUF6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00336Q6ZUF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00336Q6ZUF6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00336Q6ZUF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00336Q6ZUF6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms