Protein–RNA interactions for Protein: Q6QN14

USP17L6P, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L6PQ6QN14 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
USP17L6PQ6QN14 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
USP17L6PQ6QN14 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
USP17L6PQ6QN14 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
USP17L6PQ6QN14 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
USP17L6PQ6QN14 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
USP17L6PQ6QN14 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
USP17L6PQ6QN14 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms