Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MALRD1Q5VYJ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MALRD1Q5VYJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MALRD1Q5VYJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MALRD1Q5VYJ5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MALRD1Q5VYJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MALRD1Q5VYJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms