Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGY1

TMCO4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO4Q5TGY1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMCO4Q5TGY1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMCO4Q5TGY1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMCO4Q5TGY1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMCO4Q5TGY1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMCO4Q5TGY1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMCO4Q5TGY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms