Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DEPDC1Q5TB30 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DEPDC1Q5TB30 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DEPDC1Q5TB30 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DEPDC1Q5TB30 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DEPDC1Q5TB30 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DEPDC1Q5TB30 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms