Protein–RNA interactions for Protein: Q5TAH2

SLC9C2, Sodium/hydrogen exchanger 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C2Q5TAH2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SLC9C2Q5TAH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SLC9C2Q5TAH2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SLC9C2Q5TAH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SLC9C2Q5TAH2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SLC9C2Q5TAH2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SLC9C2Q5TAH2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SLC9C2Q5TAH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC9C2Q5TAH2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC9C2Q5TAH2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SLC9C2Q5TAH2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
SLC9C2Q5TAH2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms