Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C4orf48Q5BLP8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf48Q5BLP8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C4orf48Q5BLP8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf48Q5BLP8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms