Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ANKRD39Q53RE8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ANKRD39Q53RE8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ANKRD39Q53RE8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD39Q53RE8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ANKRD39Q53RE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms