Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FNDC1Q4ZHG4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FNDC1Q4ZHG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FNDC1Q4ZHG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FNDC1Q4ZHG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FNDC1Q4ZHG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
FNDC1Q4ZHG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FNDC1Q4ZHG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms