Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
DUSP28Q4G0W2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DUSP28Q4G0W2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DUSP28Q4G0W2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DUSP28Q4G0W2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DUSP28Q4G0W2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUSP28Q4G0W2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DUSP28Q4G0W2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DUSP28Q4G0W2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DUSP28Q4G0W2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DUSP28Q4G0W2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DUSP28Q4G0W2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms