Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTU2Q2VPK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CTU2Q2VPK5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTU2Q2VPK5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTU2Q2VPK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU2Q2VPK5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU2Q2VPK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTU2Q2VPK5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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