Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMA3Q16787 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMA3Q16787 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LAMA3Q16787 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LAMA3Q16787 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LAMA3Q16787 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LAMA3Q16787 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LAMA3Q16787 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LAMA3Q16787 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMA3Q16787 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMA3Q16787 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms