Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIP4Q15650 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIP4Q15650 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIP4Q15650 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIP4Q15650 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIP4Q15650 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIP4Q15650 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP4Q15650 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP4Q15650 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP4Q15650 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIP4Q15650 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP4Q15650 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP4Q15650 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIP4Q15650 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIP4Q15650 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIP4Q15650 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIP4Q15650 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIP4Q15650 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIP4Q15650 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
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