Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 HIRIP3-205ENST00000565996 582 ntTSL 29.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 72.5
EFTUD2Q15029 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 210.05□□□□□ -0.83e-17■■■■■ 72.2
EFTUD2Q15029 ATXN2L-212ENST00000564035 786 ntTSL 215.55■□□□□ 0.087e-13■■■■■ 72.2
EFTUD2Q15029 HES6-209ENST00000450098 530 ntTSL 331.83■■■□□ 2.691e-7■■■■■ 71.9
EFTUD2Q15029 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.471e-7■■■■■ 71.9
EFTUD2Q15029 HES6-208ENST00000436051 512 ntTSL 322.31■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 71.9
EFTUD2Q15029 LYPLA1-210ENST00000521352 580 ntTSL 518.21■□□□□ 0.512e-10■■■■■ 71.9
EFTUD2Q15029 CHAMP1-201ENST00000361283 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.548e-12■■■■■ 71.5
EFTUD2Q15029 GCLM-202ENST00000462183 583 ntTSL 311.17□□□□□ -0.621e-14■■■■■ 71.1
EFTUD2Q15029 STMN3-205ENST00000634126 605 ntTSL 38.71□□□□□ -1.025e-12■■■■■ 70.9
EFTUD2Q15029 PRPF40A-206ENST00000471167 333 ntTSL 24.4□□□□□ -1.714e-13■■■■■ 70.9
EFTUD2Q15029 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 48.76□□□□□ -1.019e-12■■■■■ 70.8
EFTUD2Q15029 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 515.68■□□□□ 0.19e-9■■■■■ 70.7
EFTUD2Q15029 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.151e-8■■■■■ 70.7
EFTUD2Q15029 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-9■■■■■ 70.7
EFTUD2Q15029 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 510.93□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 70.7
EFTUD2Q15029 CRIP1-205ENST00000461556 638 ntTSL 216.14■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 DGKD-208ENST00000471764 270 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-9■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-215ENST00000623163 851 ntTSL 513.3□□□□□ -0.283e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-206ENST00000428833 641 ntTSL 211.29□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-220ENST00000624128 672 ntTSL 28.72□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 ZC3H15-201ENST00000337859 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.049e-9■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-218ENST00000623901 711 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-217ENST00000623650 886 ntTSL 57.99□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-216ENST00000623267 374 ntTSL 55.75□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-204ENST00000425170 489 ntTSL 25.13□□□□□ -1.593e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SNHG5-208ENST00000433843 388 ntTSL 21.64□□□□□ -2.153e-7■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 SETD6-209ENST00000467320 924 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-10■■■■■ 70.6
EFTUD2Q15029 ABCC10-206ENST00000443426 774 ntTSL 220.02■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 70.3
EFTUD2Q15029 GCAT-203ENST00000415371 552 ntTSL 421.17■□□□□ 0.982e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-205ENST00000445195 583 ntTSL 321.17■□□□□ 0.982e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.352e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-204ENST00000426858 558 ntTSL 416.78■□□□□ 0.282e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-207ENST00000478203 551 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.242e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 GCAT-206ENST00000451984 716 ntTSL 312.86□□□□□ -0.352e-13■■■■■ 70
EFTUD2Q15029 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.355e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.045e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-207ENST00000529847 920 ntTSL 220.71■□□□□ 0.915e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-208ENST00000530410 971 ntTSL 218.14■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.415e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.215e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-209ENST00000531037 1560 ntTSL 315.61■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.126e-13■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 CAPN7-202ENST00000415565 742 ntTSL 55.12□□□□□ -1.596e-13■■■■■ 69.9
EFTUD2Q15029 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.533e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-229ENST00000637208 8283 ntTSL 55.48□□□□□ -1.533e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-226ENST00000636635 122 ntTSL 54.95□□□□□ -1.623e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.623e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.73e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.83e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.83e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.823e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.853e-16■■■■■ 69.7
EFTUD2Q15029 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.391e-9■■■■■ 69.6
EFTUD2Q15029 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.631e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.311e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-204ENST00000518546 746 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-207ENST00000519926 857 ntTSL 310.75□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-212ENST00000521898 344 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-213ENST00000522007 250 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.861e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-203ENST00000517297 927 ntTSL 1 (best)7.41□□□□□ -1.221e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 LYPLA1-211ENST00000521856 764 ntTSL 26.31□□□□□ -1.41e-10■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 EEF1A1-208ENST00000491404 633 ntTSL 34.29□□□□□ -1.723e-20■■■■■ 69.5
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-212ENST00000556575 850 ntTSL 517.11■□□□□ 0.339e-7■■■■■ 69.4
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-203ENST00000524814 550 ntTSL 316.32■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 69.4
EFTUD2Q15029 RPS6KB2-202ENST00000420069 461 ntTSL 314.62□□□□□ -0.079e-7■■■■■ 69.4
EFTUD2Q15029 SLC43A3-211ENST00000529112 653 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-12■■■■■ 69.3
EFTUD2Q15029 SLC43A3-212ENST00000529113 541 ntTSL 513.07□□□□□ -0.322e-12■■■■■ 69.3
EFTUD2Q15029 TOE1-205ENST00000495703 2173 ntTSL 214.62□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 69.1
EFTUD2Q15029 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-7■■■■■ 69.1
EFTUD2Q15029 TOE1-204ENST00000477731 994 ntTSL 313.71□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 69.1
EFTUD2Q15029 TOE1-203ENST00000471337 1074 ntTSL 313.42□□□□□ -0.267e-7■■■■■ 69.1
EFTUD2Q15029 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-10■■■■■ 69.1
EFTUD2Q15029 LMF2-204ENST00000505981 824 ntTSL 516.56■□□□□ 0.246e-11■■■■■ 69
EFTUD2Q15029 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 314.65□□□□□ -0.062e-45■■■■■ 68.7
EFTUD2Q15029 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.388e-9■■■■■ 68.6
EFTUD2Q15029 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.418e-9■■■■■ 68.6
EFTUD2Q15029 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 312.44□□□□□ -0.429e-9■■■■■ 68.6
EFTUD2Q15029 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 512.2□□□□□ -0.468e-9■■■■■ 68.6
EFTUD2Q15029 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 68.6
EFTUD2Q15029 RPLP0-223ENST00000551783 676 ntTSL 218.14■□□□□ 0.495e-18■■■■■ 68.3
EFTUD2Q15029 COL9A2-209ENST00000490132 492 ntTSL 317.24■□□□□ 0.354e-16■■■■■ 68.3
EFTUD2Q15029 AC092073.1-201ENST00000592740 625 ntAPPRIS P1 TSL 316.76■□□□□ 0.274e-10■■■■■ 68.3
EFTUD2Q15029 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.666e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.326e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 GMPPB-204ENST00000481959 944 ntTSL 322.77■■□□□ 1.246e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 222.2■■□□□ 1.146e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 INPPL1-211ENST00000541544 530 ntTSL 221.59■■□□□ 1.056e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TBX2-203ENST00000477081 5218 ntTSL 220.8■□□□□ 0.926e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TBX2-202ENST00000419047 3344 ntTSL 1 (best)20.6■□□□□ 0.896e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 SGSM3-203ENST00000427834 793 ntTSL 219.28■□□□□ 0.686e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.636e-10■■■■■ 68
EFTUD2Q15029 GMPPB-205ENST00000495627 711 ntTSL 218.63■□□□□ 0.576e-10■■■■■ 68
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