RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481959.1

GMPPB-204, Transcript of GDP-mannose pyrophosphorylase B, humanhuman

TSL 3

Gene GMPPB, Length 944 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMPPB-204ENST00000481959 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.93■■■■■ 7.02
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GMPPB-204ENST00000481959 ABCC9O60706 1549 aa51.82■■■■■ 5.89
GMPPB-204ENST00000481959 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.65■■■■■ 5.54
GMPPB-204ENST00000481959 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.53■■■■■ 5.52
GMPPB-204ENST00000481959 NACADO15069 1562 aa49.51■■■■■ 5.52
GMPPB-204ENST00000481959 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.1■■■■■ 5.45
GMPPB-204ENST00000481959 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
GMPPB-204ENST00000481959 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.74■■■■■ 5.39
GMPPB-204ENST00000481959 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.43■■■■■ 5.34
GMPPB-204ENST00000481959 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.32■■■■■ 5.33
GMPPB-204ENST00000481959 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.11■■■■■ 5.29
GMPPB-204ENST00000481959 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.96■■■■■ 5.27
GMPPB-204ENST00000481959 SCRIBQ14160 1630 aa47.88■■■■■ 5.25
GMPPB-204ENST00000481959 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.65■■■■■ 5.22
GMPPB-204ENST00000481959 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.91■■■■■ 5.1
GMPPB-204ENST00000481959 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.8■■■■■ 5.08
GMPPB-204ENST00000481959 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.63■■■■■ 5.05
GMPPB-204ENST00000481959 SMARCA4P51532 1647 aa45.75■■■■■ 4.91
GMPPB-204ENST00000481959 NCAPD3P42695 1498 aa45.74■■■■■ 4.91
GMPPB-204ENST00000481959 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
GMPPB-204ENST00000481959 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.68■■■■■ 4.9
GMPPB-204ENST00000481959 SMARCA2P51531 1590 aa45.58■■■■■ 4.89
GMPPB-204ENST00000481959 HMGXB3Q12766 1538 aa45.41■■■■■ 4.86
GMPPB-204ENST00000481959 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.39■■■■■ 4.86
GMPPB-204ENST00000481959 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.33■■■■■ 4.85
GMPPB-204ENST00000481959 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
GMPPB-204ENST00000481959 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
GMPPB-204ENST00000481959 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
GMPPB-204ENST00000481959 ERCC6Q03468 1493 aa44.73■■■■■ 4.75
GMPPB-204ENST00000481959 NESP48681 1621 aa44.7■■■■■ 4.75
GMPPB-204ENST00000481959 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.52■■■■■ 4.72
GMPPB-204ENST00000481959 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.41■■■■■ 4.7
GMPPB-204ENST00000481959 CUX2O14529 1486 aa44.39■■■■■ 4.7
GMPPB-204ENST00000481959 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
GMPPB-204ENST00000481959 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.33■■■■■ 4.69
GMPPB-204ENST00000481959 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
GMPPB-204ENST00000481959 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.04■■■■■ 4.64
GMPPB-204ENST00000481959 CFTRP13569 1480 aa44.02■■■■■ 4.64
GMPPB-204ENST00000481959 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.9■■■■■ 4.62
GMPPB-204ENST00000481959 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.86■■■■■ 4.61
GMPPB-204ENST00000481959 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.85■■■■■ 4.61
GMPPB-204ENST00000481959 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
GMPPB-204ENST00000481959 WDR62O43379 1518 aa43.68■■■■■ 4.58
GMPPB-204ENST00000481959 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.54■■■■■ 4.56
GMPPB-204ENST00000481959 PRDM2Q13029 1718 aa43.43■■■■■ 4.54
GMPPB-204ENST00000481959 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
GMPPB-204ENST00000481959 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
GMPPB-204ENST00000481959 ABCC8Q09428 1581 aa43.11■■■■■ 4.49
GMPPB-204ENST00000481959 TOPBP1Q92547 1522 aa43.09■■■■■ 4.49
GMPPB-204ENST00000481959 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
GMPPB-204ENST00000481959 IFT140Q96RY7 1462 aa42.96■■■■■ 4.47
GMPPB-204ENST00000481959 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
GMPPB-204ENST00000481959 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.7■■■■■ 4.43
GMPPB-204ENST00000481959 CUX1P39880 1505 aa42.61■■■■■ 4.41
GMPPB-204ENST00000481959 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
GMPPB-204ENST00000481959 SOGA1O94964 1423 aa42.58■■■■■ 4.41
GMPPB-204ENST00000481959 OSCARQ8IYS5 282 aa42.56■■■■■ 4.4
GMPPB-204ENST00000481959 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.54■■■■■ 4.4
GMPPB-204ENST00000481959 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.54■■■■■ 4.4
GMPPB-204ENST00000481959 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.5■■■■■ 4.39
GMPPB-204ENST00000481959 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
GMPPB-204ENST00000481959 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
GMPPB-204ENST00000481959 WDR97A6NE52 1622 aa42.27■■■■■ 4.36
GMPPB-204ENST00000481959 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.24■■■■■ 4.35
GMPPB-204ENST00000481959 FBLN2P98095 1184 aa42.14■■■■■ 4.34
GMPPB-204ENST00000481959 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.12■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 TOP2BQ02880 1626 aa42.11■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 GRIN2BQ13224 1484 aa42.11■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.08■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.07■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 SYNJ1O43426 1573 aa42.07■■■■■ 4.33
GMPPB-204ENST00000481959 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.05■■■■■ 4.32
GMPPB-204ENST00000481959 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
GMPPB-204ENST00000481959 CHD1O14646 1710 aa41.98■■■■■ 4.31
GMPPB-204ENST00000481959 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
GMPPB-204ENST00000481959 TRIM41Q8WV44 630 aa41.95■■■■■ 4.31
GMPPB-204ENST00000481959 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.91■■■■■ 4.3
GMPPB-204ENST00000481959 SYNJ2O15056 1496 aa41.86■■■■■ 4.29
GMPPB-204ENST00000481959 PBRM1Q86U86 1689 aa41.83■■■■■ 4.29
GMPPB-204ENST00000481959 ARHGEF11O15085 1522 aa41.75■■■■■ 4.27
GMPPB-204ENST00000481959 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
GMPPB-204ENST00000481959 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
GMPPB-204ENST00000481959 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.75■■■■■ 4.27
GMPPB-204ENST00000481959 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.61■■■■■ 4.25
GMPPB-204ENST00000481959 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.6■■■■■ 4.25
GMPPB-204ENST00000481959 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.57■■■■■ 4.25
GMPPB-204ENST00000481959 ADAMTS12P58397 1594 aa41.56■■■■■ 4.24
GMPPB-204ENST00000481959 GRIN2AQ12879 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
GMPPB-204ENST00000481959 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.5■■■■■ 4.23
GMPPB-204ENST00000481959 KIF27Q86VH2 1401 aa41.42■■■■■ 4.22
GMPPB-204ENST00000481959 ARAP1Q96P48 1450 aa41.4■■■■■ 4.22
GMPPB-204ENST00000481959 NUP160Q12769 1436 aa41.38■■■■■ 4.22
GMPPB-204ENST00000481959 IGF1RP08069 1367 aa41.31■■■■■ 4.2
GMPPB-204ENST00000481959 CEP170Q5SW79 1584 aa41.3■■■■■ 4.2
GMPPB-204ENST00000481959 CUL7Q14999 1698 aa41.09■■■■■ 4.17
GMPPB-204ENST00000481959 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.06■■■■■ 4.16
GMPPB-204ENST00000481959 JPH4Q96JJ6 628 aa41.03■■■■■ 4.16
GMPPB-204ENST00000481959 SHROOM2Q13796 1616 aa41.02■■■■■ 4.16
GMPPB-204ENST00000481959 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.99■■■■■ 4.15
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