Protein–RNA interactions for Protein: Q14190

SIM2, Single-minded homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM2Q14190 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SIM2Q14190 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SIM2Q14190 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SIM2Q14190 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SIM2Q14190 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SIM2Q14190 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SIM2Q14190 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SIM2Q14190 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM2Q14190 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM2Q14190 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM2Q14190 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SIM2Q14190 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms