Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MADCAM1Q13477 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MADCAM1Q13477 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MADCAM1Q13477 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MADCAM1Q13477 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MADCAM1Q13477 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MADCAM1Q13477 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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