Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENBP1Q13228 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SELENBP1Q13228 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SELENBP1Q13228 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SELENBP1Q13228 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SELENBP1Q13228 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SELENBP1Q13228 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SELENBP1Q13228 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms