Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.811e-17■■■■■ 52.1
TARDBPQ13148 GART-202ENST00000366093 805 ntTSL 37.71□□□□□ -1.181e-17■■■■■ 52.1
TARDBPQ13148 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.191e-17■■■■■ 52.1
TARDBPQ13148 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)7.14□□□□□ -1.271e-17■■■■■ 52.1
TARDBPQ13148 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.311e-17■■■■■ 52.1
TARDBPQ13148 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-17■■■■■ 52.1
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TARDBPQ13148 IP6K1-208ENST00000498149 687 ntTSL 417.71■□□□□ 0.433e-8■■■■■ 52
TARDBPQ13148 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.073e-8■■■■■ 52
TARDBPQ13148 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-8■■■■■ 52
TARDBPQ13148 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 52
TARDBPQ13148 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-8■■■■■ 52
TARDBPQ13148 TNFAIP8-202ENST00000388882 541 ntTSL 410□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 51.9
TARDBPQ13148 TNFAIP8-201ENST00000274456 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -14e-7■■■■■ 51.9
TARDBPQ13148 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.513e-36■■■■■ 51.8
TARDBPQ13148 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.73e-36■■■■■ 51.8
TARDBPQ13148 IKZF1-212ENST00000462201 1122 ntTSL 38.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 51.8
TARDBPQ13148 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 216.88■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 51.7
TARDBPQ13148 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.299e-16■■■■■ 51.6
TARDBPQ13148 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.292e-7■■■■■ 51.4
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TARDBPQ13148 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-7■■■■■ 51.4
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TARDBPQ13148 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 12e-7■■■■■ 51.4
TARDBPQ13148 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 51.4
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TARDBPQ13148 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 51.4
TARDBPQ13148 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.572e-7■■■■■ 51.4
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TARDBPQ13148 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 51.4
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TARDBPQ13148 KLC1-204ENST00000348520 15091 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 51.4
TARDBPQ13148 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 51.3
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TARDBPQ13148 IKZF1-208ENST00000426121 201 ntTSL 1 (best)6.39□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 51.2
TARDBPQ13148 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 51
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TARDBPQ13148 KLHDC4-226ENST00000569747 560 ntTSL 413.86□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 51
TARDBPQ13148 KLHDC4-213ENST00000564484 562 ntTSL 510.37□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 51
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TARDBPQ13148 ANP32E-206ENST00000534220 512 ntTSL 57.91□□□□□ -1.148e-12■■■■■ 51
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TARDBPQ13148 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 50.9
TARDBPQ13148 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-8■■■■■ 50.9
TARDBPQ13148 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 02e-8■■■■■ 50.9
TARDBPQ13148 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.482e-8■■■■■ 50.9
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TARDBPQ13148 PNMA8A-202ENST00000438932 3335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-15■■■■■ 50.9
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TARDBPQ13148 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 50.6
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TARDBPQ13148 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 50.6
TARDBPQ13148 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 50.6
TARDBPQ13148 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.655e-13■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-207ENST00000397034 728 ntTSL 313.74□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-202ENST00000372503 993 ntTSL 213.74□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-204ENST00000372506 1859 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-203ENST00000372504 1935 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 ZNF691-205ENST00000372507 1683 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.761e-8■■■■■ 50.5
TARDBPQ13148 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.212e-15■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.862e-15■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.562e-15■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 DYRK1A-208ENST00000498351 224 ntTSL 1 (best)2.5□□□□□ -2.012e-15■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-36■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.112e-36■■■■■ 50.4
TARDBPQ13148 ATXN2-218ENST00000549455 568 ntTSL 414.95□□□□□ -0.024e-13■■■■■ 50.3
TARDBPQ13148 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 46.08□□□□□ -1.444e-13■■■■■ 50.3
TARDBPQ13148 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 327.28■■□□□ 1.965e-11■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.285e-11■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 AXIN1-204ENST00000461023 6340 ntTSL 215.19■□□□□ 0.025e-11■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.475e-11■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-25■■■■■ 50.1
TARDBPQ13148 MTRR-223ENST00000513439 2441 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.187e-12■■■■■ 50.1
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