Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACACAQ13085 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACACAQ13085 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACACAQ13085 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ACACAQ13085 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACACAQ13085 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACACAQ13085 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACACAQ13085 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ACACAQ13085 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 962.1 ms