Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
MKRN3Q13064 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
MKRN3Q13064 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MKRN3Q13064 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
MKRN3Q13064 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
MKRN3Q13064 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MKRN3Q13064 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MKRN3Q13064 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MKRN3Q13064 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MKRN3Q13064 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MKRN3Q13064 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
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